当黑线仓鼠受到外界刺激时它们会发出激烈的叫声,黑线仓鼠对自己的生活习惯要求很高,它们的、食、便处从不混用,具有按食物种类分藏的习性。
一般一个洞穴内只有1只成体鼠,幼鼠和亚成体鼠与母鼠分居,在距母巢35~100m处建筑洞穴。母鼠与幼鼠在同一领域内呈圆形分布,在其领域内几乎没有其它鼠类建筑洞穴,但允许在其范围内绕行活动。雌雄比1∶3.7。黑线仓鼠可在距离洞穴80~200m的范围内活动,但以80~150m范围内活动最频繁,雨后较晴天活动频繁,冬季活动范围小,主要依靠存粮为生。5~6月和10~11月为数量高峰期,不冬眠。该鼠食性杂,以小麦、玉米、豆类等作物的种子为主要食料,占食料的60%以上,杂草籽次之,占20%,还取食少量昆虫和植物茎、叶、根等。