蓝尾水巨蜥是群居的动物，温暖潮湿的居所，它们可以在任何有水的地方生存。它们是一种机会主义食肉动物，食物包括蛋、鸟类、软体动物、啮齿动物、昆虫、螃蟹、小型蜥蜴、鱼类和腐尸。蓝尾水巨蜥泳技一流(甚至可穿越浩翰的海洋)，广泛的食性以及多产的习性导致其广泛的分布和许多地区大的种群数量。如果它们不受干扰，它们可以和人类和睦共存，而且可以成为废物消费者，即使在捕猎地区它们仍然能够维持高的密集度。成年蓝尾巨蜥雌性不易分辨，缺乏明显的两态性，只有部分小岛上的雄性蓝尾巨蜥被报道体型是雌性的两到三倍。 雄性会为了争斗配偶而争斗，交配时雄性会在骑到雌性背上之后用下巴摩擦雌性的头部和身体前端。交配时雄性和雌性可能会进行360度旋转，雄性一直保持上位。交配后，雌性会产下2至12枚卵，卵的长度约为3.5-5厘米。卵呈椭圆形，七至八个月后幼年蓝尾巨蜥就会孵出,现已有成功的人工繁殖记录。